Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r44Q9EQ47 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms