Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sil1Q9EPK6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sil1Q9EPK6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sil1Q9EPK6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sil1Q9EPK6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sil1Q9EPK6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sil1Q9EPK6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sil1Q9EPK6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sil1Q9EPK6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sil1Q9EPK6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sil1Q9EPK6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sil1Q9EPK6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sil1Q9EPK6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sil1Q9EPK6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sil1Q9EPK6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sil1Q9EPK6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sil1Q9EPK6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sil1Q9EPK6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sil1Q9EPK6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sil1Q9EPK6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sil1Q9EPK6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sil1Q9EPK6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sil1Q9EPK6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sil1Q9EPK6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sil1Q9EPK6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sil1Q9EPK6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sil1Q9EPK6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sil1Q9EPK6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sil1Q9EPK6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sil1Q9EPK6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sil1Q9EPK6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sil1Q9EPK6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sil1Q9EPK6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sil1Q9EPK6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sil1Q9EPK6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sil1Q9EPK6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sil1Q9EPK6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sil1Q9EPK6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sil1Q9EPK6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sil1Q9EPK6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sil1Q9EPK6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sil1Q9EPK6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sil1Q9EPK6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sil1Q9EPK6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sil1Q9EPK6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sil1Q9EPK6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sil1Q9EPK6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sil1Q9EPK6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sil1Q9EPK6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms