Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bap18Q9DCT6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms