Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB05

Napa, Alpha-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapaQ9DB05 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NapaQ9DB05 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NapaQ9DB05 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NapaQ9DB05 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms