Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9DA42 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9DA42 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9DA42 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9DA42 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9DA42 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9DA42 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9DA42 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9DA42 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9DA42 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9DA42 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9DA42 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9DA42 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9DA42 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9DA42 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9DA42 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9DA42 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9DA42 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9DA42 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9DA42 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9DA42 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9DA42 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9DA42 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9DA42 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9DA42 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9DA42 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9DA42 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9DA42 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9DA42 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9DA42 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9DA42 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9DA42 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9DA42 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9DA42 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9DA42 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9DA42 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9DA42 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9DA42 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9DA42 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9DA42 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9DA42 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9DA42 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9DA42 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9DA42 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9DA42 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9DA42 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9DA42 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9DA42 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9DA42 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9DA42 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9DA42 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9DA42 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9DA42 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9DA42 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9DA42 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9DA42 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9DA42 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9DA42 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9DA42 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9DA42 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9DA42 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9DA42 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9DA42 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9DA42 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9DA42 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9DA42 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9DA42 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9DA42 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9DA42 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9DA42 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9DA42 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9DA42 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9DA42 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9DA42 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9DA42 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9DA42 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9DA42 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9DA42 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9DA42 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9DA42 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9DA42 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9DA42 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9DA42 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9DA42 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9DA42 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9DA42 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9DA42 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9DA42 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9DA42 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9DA42 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9DA42 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9DA42 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9DA42 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9DA42 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DA42 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DA42 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DA42 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DA42 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DA42 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DA42 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms