Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Q9D9H8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Q9D9H8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Q9D9H8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Q9D9H8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Q9D9H8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Q9D9H8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Q9D9H8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Q9D9H8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Q9D9H8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Q9D9H8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Q9D9H8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Q9D9H8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Q9D9H8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Q9D9H8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Q9D9H8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms