Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Speer4bQ9D9F7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Speer4bQ9D9F7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Speer4bQ9D9F7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Speer4bQ9D9F7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4bQ9D9F7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms