Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnot8Q9D8X5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms