Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SlirpQ9D8T7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlirpQ9D8T7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms