Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Jam3Q9D8B7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Jam3Q9D8B7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms