Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2af1Q9D883 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
U2af1Q9D883 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms