Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmigd1Q9D7L8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms