Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn23Q9D7D7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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