Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J5

Ndufb8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb8Q9D6J5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb8Q9D6J5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb8Q9D6J5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb8Q9D6J5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb8Q9D6J5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb8Q9D6J5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb8Q9D6J5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb8Q9D6J5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb8Q9D6J5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb8Q9D6J5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb8Q9D6J5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb8Q9D6J5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb8Q9D6J5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms