Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cmtm5Q9D6G9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cmtm5Q9D6G9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms