Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc39Q9D5Y1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc39Q9D5Y1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms