Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Phf6Q9D4J7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Phf6Q9D4J7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms