Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Clvs1Q9D4C9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms