Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx29Q9D3S3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx29Q9D3S3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms