Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt20Q9D312 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt20Q9D312 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt20Q9D312 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt20Q9D312 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt20Q9D312 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt20Q9D312 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt20Q9D312 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt20Q9D312 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt20Q9D312 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt20Q9D312 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt20Q9D312 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Krt20Q9D312 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt20Q9D312 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt20Q9D312 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt20Q9D312 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt20Q9D312 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt20Q9D312 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt20Q9D312 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt20Q9D312 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt20Q9D312 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt20Q9D312 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt20Q9D312 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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