Protein–RNA interactions for Protein: Q9D309

Fam3b, Protein FAM3B, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3bQ9D309 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam3bQ9D309 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam3bQ9D309 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms