Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zbed3Q9D0L1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Zbed3Q9D0L1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms