Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc47Q9D024 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc47Q9D024 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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