Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Mis12Q9CY25 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mis12Q9CY25 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mis12Q9CY25 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms