Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nip7Q9CXK8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nip7Q9CXK8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nip7Q9CXK8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms