Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Yif1bQ9CX30 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Yif1bQ9CX30 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Yif1bQ9CX30 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Yif1bQ9CX30 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Yif1bQ9CX30 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Yif1bQ9CX30 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Yif1bQ9CX30 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Yif1bQ9CX30 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Yif1bQ9CX30 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Yif1bQ9CX30 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Yif1bQ9CX30 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Yif1bQ9CX30 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Yif1bQ9CX30 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Yif1bQ9CX30 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Yif1bQ9CX30 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Yif1bQ9CX30 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Yif1bQ9CX30 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Yif1bQ9CX30 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Yif1bQ9CX30 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Yif1bQ9CX30 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Yif1bQ9CX30 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms