Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp23Q9CX11 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Utp23Q9CX11 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms