Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd4Q9CWX4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms