Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9CWU4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9CWU4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9CWU4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9CWU4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CWU4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CWU4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CWU4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9CWU4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CWU4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CWU4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CWU4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CWU4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CWU4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CWU4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CWU4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9CWU4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms