Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NubplQ9CWD8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms