Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smc3Q9CW03 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smc3Q9CW03 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc3Q9CW03 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc3Q9CW03 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc3Q9CW03 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc3Q9CW03 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc3Q9CW03 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc3Q9CW03 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc3Q9CW03 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc3Q9CW03 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smc3Q9CW03 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms