Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930535I16RikQ9CUI2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms