Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRG1

Tm7sf3, Transmembrane 7 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm7sf3Q9CRG1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm7sf3Q9CRG1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm7sf3Q9CRG1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm7sf3Q9CRG1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm7sf3Q9CRG1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm7sf3Q9CRG1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm7sf3Q9CRG1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm7sf3Q9CRG1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm7sf3Q9CRG1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm7sf3Q9CRG1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm7sf3Q9CRG1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm7sf3Q9CRG1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm7sf3Q9CRG1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm7sf3Q9CRG1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm7sf3Q9CRG1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm7sf3Q9CRG1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm7sf3Q9CRG1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm7sf3Q9CRG1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm7sf3Q9CRG1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm7sf3Q9CRG1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm7sf3Q9CRG1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm7sf3Q9CRG1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm7sf3Q9CRG1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm7sf3Q9CRG1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms