Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms