Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rer1Q9CQU3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms