Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Mrpl11Q9CQF0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mrpl11Q9CQF0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl11Q9CQF0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl11Q9CQF0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl11Q9CQF0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl11Q9CQF0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl11Q9CQF0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl11Q9CQF0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl11Q9CQF0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mrpl11Q9CQF0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl11Q9CQF0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl11Q9CQF0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl11Q9CQF0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl11Q9CQF0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl11Q9CQF0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl11Q9CQF0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl11Q9CQF0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl11Q9CQF0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl11Q9CQF0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl11Q9CQF0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl11Q9CQF0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl11Q9CQF0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl11Q9CQF0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms