Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE6

Asf1a, Histone chaperone ASF1A, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1aQ9CQE6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Asf1aQ9CQE6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Asf1aQ9CQE6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Asf1aQ9CQE6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Asf1aQ9CQE6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Asf1aQ9CQE6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Asf1aQ9CQE6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Asf1aQ9CQE6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Asf1aQ9CQE6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Asf1aQ9CQE6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Asf1aQ9CQE6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Asf1aQ9CQE6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Asf1aQ9CQE6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Asf1aQ9CQE6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Asf1aQ9CQE6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Asf1aQ9CQE6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Asf1aQ9CQE6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Asf1aQ9CQE6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Asf1aQ9CQE6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Asf1aQ9CQE6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Asf1aQ9CQE6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Asf1aQ9CQE6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Asf1aQ9CQE6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Asf1aQ9CQE6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Asf1aQ9CQE6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Asf1aQ9CQE6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Asf1aQ9CQE6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms