Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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