Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc5Q9CQA1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc5Q9CQA1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc5Q9CQA1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms