Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg3Q9CPX6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atg3Q9CPX6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg3Q9CPX6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 241.3 ms