Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nup155Q99P88 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nup155Q99P88 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nup155Q99P88 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nup155Q99P88 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nup155Q99P88 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Nup155Q99P88 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nup155Q99P88 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup155Q99P88 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup155Q99P88 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms