Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Bco2Q99NF1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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