Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rims1Q99NE5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rims1Q99NE5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rims1Q99NE5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms