Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hdac9Q99N13 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac9Q99N13 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms