Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KarsQ99MN1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KarsQ99MN1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KarsQ99MN1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KarsQ99MN1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KarsQ99MN1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KarsQ99MN1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KarsQ99MN1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KarsQ99MN1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KarsQ99MN1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KarsQ99MN1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KarsQ99MN1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KarsQ99MN1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KarsQ99MN1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KarsQ99MN1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KarsQ99MN1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KarsQ99MN1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KarsQ99MN1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KarsQ99MN1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KarsQ99MN1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KarsQ99MN1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KarsQ99MN1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KarsQ99MN1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KarsQ99MN1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KarsQ99MN1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KarsQ99MN1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KarsQ99MN1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KarsQ99MN1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KarsQ99MN1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KarsQ99MN1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KarsQ99MN1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KarsQ99MN1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KarsQ99MN1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KarsQ99MN1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KarsQ99MN1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KarsQ99MN1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KarsQ99MN1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KarsQ99MN1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KarsQ99MN1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KarsQ99MN1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KarsQ99MN1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KarsQ99MN1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KarsQ99MN1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms