Protein–RNA interactions for Protein: Q99MI1

Erc1, ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erc1Q99MI1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Erc1Q99MI1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Erc1Q99MI1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Erc1Q99MI1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Erc1Q99MI1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Erc1Q99MI1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Erc1Q99MI1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Erc1Q99MI1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Erc1Q99MI1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Erc1Q99MI1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Erc1Q99MI1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Erc1Q99MI1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Erc1Q99MI1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Erc1Q99MI1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Erc1Q99MI1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Erc1Q99MI1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Erc1Q99MI1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Erc1Q99MI1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Erc1Q99MI1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Erc1Q99MI1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Erc1Q99MI1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms