Protein–RNA interactions for Protein: Q99MD6

Txnrd3, Thioredoxin reductase 3, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd3Q99MD6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Txnrd3Q99MD6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Txnrd3Q99MD6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Txnrd3Q99MD6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Txnrd3Q99MD6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Txnrd3Q99MD6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Txnrd3Q99MD6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms