Protein–RNA interactions for Protein: Q99M73

Krt84, Keratin, type II cuticular Hb4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt84Q99M73 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt84Q99M73 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt84Q99M73 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt84Q99M73 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt84Q99M73 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt84Q99M73 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt84Q99M73 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt84Q99M73 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt84Q99M73 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt84Q99M73 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt84Q99M73 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt84Q99M73 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt84Q99M73 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt84Q99M73 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt84Q99M73 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt84Q99M73 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt84Q99M73 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt84Q99M73 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms