Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cstf3Q99LI7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms