Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp5lQ99LH9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sh3bp5lQ99LH9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms